mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAATGGTTTAGTGAGGTC TCGAACTTGATCATTTAGAGG CGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGGTCCTCGGATTGGCCCCGCTGCTGCTGGAAACAGTGTCGGCGGCGTGCTGAAAAGAAAATCGAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAA CGCGTCCGCGGACGCGTGGGCTAGTGGCGCTTTANCCACACGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCGGGGCTGCACGCGCGCTACAATGAATAACTCAGCGTGTGTTATACCTTGGCCGAAAGGTCTGGGAAATCCCCTTAAATTTATTCGTGATTGGGATAGAGATCTGGAATCTTCTCTTAAACGAGGAATTCCCAGTAAATGCGAATCATCAGTTCGCTTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGGTCCTCGGATTGGCCCCGCTGCTGCTGGAAACAGTGTCGGCGGCGTGCTGAAAAGAAAATCGAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTAACAGGATTGCTTTAGCGAAACTGTTGTGGCGCGGATAGAACCCGGGACGGGTCCGCGCCCTAAAGAAATTTGACCGTCTCGGTCGTGTTCGGCTGCG 5 0 5' arm Molgula_tectiformis mirnest SSU_rRNA_eukarya 3e-20 100 -38.9 ...((((.((..((((((((((.(((..(((..((...(((((.((((((.(((((....))))).))))))...)))))...))..)))..))).)))))))))).)).))))... (-38.9)