mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATGCTGCTGCTGATGAGGAT AACAGCTCCAGTGACAGCATCAT TACGTGACGAAGTGTTGGTGATGTTGAATGCTATCAGTCGAGATGCTGCTGCTGATGAGGATGACGATGAGGAGGATGCTGAAGACGAGGAAGAGGCGGAAGGTATCTTCGTTGACGTTAAAACAGCTCCAGTGACAGCATCATGGAGGTAGATCAAATGATGATGAGGACGTGATGATTGG AACTACATGATAATAAAGTCTCAAGCTTGAATTGCAAGCAAAAATTTATAATTACTAAACAGATGTAGAGTCATTCATATCACGTACCAAAATTTGTTTATTTAGAATTGTGAGCGCTTTTGAGAAAGTTTAAATAGCGCTATATAGATTGTTTTTAATAATATGATACCTTCTATTGCAATAGACACTCGTGGCGATGATGATTACGATGGTGACGATGACACCAAAGATGATAGAACCGAAAAGAATACTGTAGGAAGACGATGAAAATGATGAAGACTGAGGTTTTGAATACTGCTGCAAGGAAATAGCTATTTCATTTCTAGATTCTAGTGTCAATGACGACGACGACGACGATGATGGTGAGTAGGAAACTGACACTATTCTAAAGATACGTGACGAAGTGTTGGTGATGTTGAATGCTATCAGTCGAGATGCTGCTGCTGATGAGGATGACGATGAGGAGGATGCTGAAGACGAGGAAGAGGCGGAAGGTATCTTCGTTGACGTTAAAACAGCTCCAGTGACAGCATCATGGAGGTAGATCAAATGATGATGAGGACGTGATGATTGGTTGCATTTTGTTGGCTCTGTGACGTTGACCGTGATACTCGAAGATGATTGGTTGTGCTCCTGCAGGAGGACGGGCAATGGGGAAAGATAATCGTAGCAGATTTCCTCCATCCAGCTGATTCTGCCTGCCTTCATTGAAAGGCCAAGTACCATGTTCTCAGGCCACGCGTTCATGTGTGGTTGTT 3 2 5' arm Helobdella_robusta mirnest mir-598 0.0007 100 -43.2 ..(((.(((...(((((......((((...(((((..(((.(((((((.(((((..(((..(((((.(((.(((((((((.....((.........))...))))))))).))).)))))......)))))))).))))))).))).))))).))))....)))))....))).)))..... (-43.2)