mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACGCGCGCACACACACACGC GTGTGTGTGTGCGTGCGTCTT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTCTTGGTTCCATCCTGTTTCGTGGTTTATGTTTGTACTGTTCCCCGTCATATCCTCTCGTTGATTGGTTTTATTTTAATATATCGCTTTCAACAGCGCAGTGCAAACAAAACGCGCGCACACACACACGCATGCACACTAACATGTACA GATCGCACATACATACATACGCACATACGTACACACATAACATGCATACATACATACAATACCATGCCATACCTTAAGTAAATTTTTTGTTAAAAGGCATTTCATATCATTGATTGATGGACGGTTTTAATGATTTTGTAATCATTAATTAATTAATTAATAAATTAATTAGTTGCGTGATTAATTGATTTATAGCACTAAATGTATCTATGTATCACTCTGTTACTGTATGTATACTTGTTTGTGTGTATACCTGTTCGTATGTGGTTTTGTTTTGTATGCGGTGTACATGTATGTATGTGAGTTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTCTTGGTTCCATCCTGTTTCGTGGTTTATGTTTGTACTGTTCCCCGTCATATCCTCTCGTTGATTGGTTTTATTTTAATATATCGCTTTCAACAGCGCAGTGCAAACAAAACGCGCGCACACACACACGCATGCACACTAACATGTACACAGAGGTACGAATTCACTTACACACATACACACACAGTACGTCACACCAAATGGTGTCTTACTGTCTTGCATTGTATTTCTGTGCAATGTGATGTTTGCGTTAATTTGTATCTATTTGTCGTGTTTTTTTTTTCGAATTTATATTTTGTATACAATTTAACTGTATTGTTATGCACGCTGTATGTGTGAGTGTGTGTGAGAGTTTATGTGTG 1 0 3' arm Helobdella_robusta mirnest 7SK 0.0007 100 -74.6 .(((((((((..((((((((((((((((((((((((((((..(((..((((........)))).)))((((((((((((..................(((((.((((..(((....))).))))...)))))...))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))..))))))))) (-74.6)