mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTCAATCGGTCGGTCGGT CAATCGGTCGGTCAATCAATC ACATCAGTCAATCGGTCGGTCGGTCGGTCGGTCGGTCAATCGGTCGGTCGGTCAATCAATCGGTCGGTCAATCAATCGGTCGGTCGATCAATCGATCAGTCGGTC CCACAGTACAGTGAAACCTTTGCCCTCAACGACGCCAGCCATCCAACTAACTTCAGATAACGTACACTACTCCAACGCATACGTTCCTAAAATGTACAAACACGCCCTGTATAAACACGCCCATACATACCTAAATAAATACCAACAAGAATACATTCACATTAACATACCTATAAACAAAATTGCATATACACGCTTAGCTCTAATGCGATTGAAATATAATGGCTCTTGTATATATCGATATATCCGTCTTATTAAGCCATCACAAAATCAGTCAAACATCAGTCAATCGGTCGGTCGGTCGGTCGGTCGGTCAATCGGTCGGTCGGTCAATCAATCGGTCGGTCAATCAATCGGTCGGTCGATCAATCGATCAGTCGGTCGGTCAGTCAATCGGTCAGTCAATCGGTCGGTCAATCGGTCAGTCGATTGGTCAGTCAATCAATTGATCAGTCAGTTAATCGGTCAATCAATCAATCGGTCGGTCAATCGGTTAGTCAATTAATCAATCAATTTGTCTATCAATCAATCAATCTTGAAATCAAACAACCTACCATTCACAAGTCTATATCTCTAGCCCAGCCAATAAAAAAAAGCGATTAAACCAACCCTACCATCAATTAACCAATCAGATGTTTTGTATCCGAAGCTCTTTAATATAGTCATAACAGATGGATTGAATAACTGATATGATAGAACAGTTTTTTTTATATTTTTGAAAAAGTTTGTTTTCTTTTAACATTTTAACATTTTTTCCCATAAAATTAAATCANAGAAAATAGAATTAATGAAATGAAATTATCTGGAAACAAAAAGAATTGTTTTTGTTGATTGATTGATTGTTTGATTGATTGATTGATTGATCGAG 5 0 5' arm Helobdella_robusta mirnest 100 100 -28.2 ..........((((((.(((((((((((((((.(((..((((((((((.((....)).))))))))))..))).))))))))))))))).))))))......... (-28.2)