mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGCTCGAGA TTCTTTTGTGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGACCACAAGAAAGCTTCAATCTTTATAATCTTTATGTTACATAATCACATAATTGATCAATCTTTGTTGATCAATGATTAAAGATTAGAATCTTGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCATGTGT TATCCAGGTAGATCTTTCTTTTGTGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGACCACAAGAAAGCTTCAATCTTTATAATCTTTATGTTACATAATCACATAATTGATCAATCTTTGTTGATCAATGATTAAAGATTAGAATCTTGTGTTGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCATGTGTTCTTCCTTAAATTTCAAGAAAGTTTGGATCTTTCTGCACCTACACACTTTGTTTCATCAACAAGATTCAAAATTGTTAGGTGGGTGTGCTCAAGTTTCAATCTTTTTAAAGTTTTGATAAAAAATCTTGTGATTTTTGTGTTTCTTGTGAGCATAATTTGGATAGATGATGAAGAAGAAGATTGGTGGATTCAAGATTGTTAGATAATTTGGATAGATGAAGAAAAGATAACCGATTGGTGTGGTCCATTGGCAAAGGCAAAACCTTTAAACGTTTTGGGAGGGGAGGTCTCAGGTTCAAGTCCCACAGACGACAAGATTTAAAAGAAATTTTCTGTTAAAAAAAATGAAGAAGAAGATTCGACTCCTACTTGCAGAGTGAGACACTGGTGGGCAATGATAGGAAACCCAGAGAAACCTGGGTTGGATCCTTGAGCCAAACGGGTTTTACCGGTAATTTTACTGTCGTGCCTATGGGCAGGTGGGTTACCGGGTTTTCCCCGGAATTGGTGGTGGACTCGGGTTACTCTCGGAGTACTCTGTTTGTCCAGTGGGTGCCCTGAGAGTGCTCGGGGATTGTGTTTTTTAGCCGTTAAA 3 0 3' arm Helianthus_petiolaris mirnest mir-166 0.0000006 ctr-MIR166 0.000000008 -50.4 ......((.((((((((..((((((.((((...(((((((....(((((((((((..(((.((((((.........))))))(((((((((....))))))))).))))))))))).))))))))))...)))).))))))..)))))))).))..... (-50.4)