mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGTGAGGAGGGAGAGGTGA CCCTCTGAGCTTCACTGATA AGCACAAGGGGAGCTCAGACAGTGCTGGTGTCCCCTCTGAGCTTCACTGATACCCAATTTTTGTCAGGAATACACCTGGAGGAGTCTGTGAGGAGGGAGAGGTGAACTCAGTGCTGAGCTGAGCTCTGGGAGTG GAACTTCATCAGTGGGTTTGGGTTTCTTCCTTTGAATGCTGATGATGCAAAAGAAGCTGATCTTTGTCCAGCCAGTTGAGCAATCCAGGGAAAATGGTCTTTGGAACAGGAAATGTGAAGGGAGGGAAGCTCCAGAAACCTGCCTTGAGTCATGTTTGATGTTGCTTCCCTTGGAGCCCGAGCAGGGATGAGTCAGGAAGGTTTCCCATTTTCCCAGAGCACAAGGGGAGCTCAGACAGTGCTGGTGTCCCCTCTGAGCTTCACTGATACCCAATTTTTGTCAGGAATACACCTGGAGGAGTCTGTGAGGAGGGAGAGGTGAACTCAGTGCTGAGCTGAGCTCTGGGAGTGTCCTGCAGAATTGCTGTAAAGCAGAATTTTGTGGCCTCAGGGACAAAGTATCGAGGATTTTACAGCAGCTGCTGGGTAACACAGATAACTGTGGGGAGTTTGTACCAGAAAATTGGACATTAATTTTTCCTTAAAAAGTTATTTTCTGAGCTCCTCTGGTGGGAGTGGGTTAGCACAGGAGGGCAGCTGTGAGGCTGTACAGATTGGAGACACTTTTTTGAGGGGAAAAATGG 5 1 3' arm Taeniopygia_guttata mirnest 100 100 -49.1 .........(((((((((.(((((((((..((.(((((...((((((.(((.((.........(((((......))))).)).))).))))))....))))).))..)))))))))..)))))))))....... (-49.1)