mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCATTTGCACCTGCATCTTA AGGTGCAGGTGCAAGTGCAGG TTGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTATTGCGTTTGGTTTGGTATTGAATCCAAAAAACAAATCCAAGTTCCGTGCCGATCCAGAATGTGGGACAATTAGATATGGAAACTAATAAGCTTAGTTGAGGTGCAGGTGCAAGTGCAGGTGAATGCC CTCATTGTATATAATACTACTAGTTATAGAGAGTGAGTGACAACTAGTAGCTAGCAGTTGTTTGATATAATATGATAAACAGGCTGCAGGTCATACAGGCAATATTATGCATGCCAATATGTTGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTATTGCGTTTGGTTTGGTATTGAATCCAAAAAACAAATCCAAGTTCCGTGCCGATCCAGAATGTGGGACAATTAGATATGGAAACTAATAAGCTTAGTTGAGGTGCAGGTGCAAGTGCAGGTGAATGCCATTTGGGTAATGTTTTCACTCCCATATATACACAGCAGTGCTGCCTCTTTTCTTTTCATCTGTCTGTGGTTAATTTGCAGTTTCATGGTGGCAGAAATATTGTACTGGTAATCATCAAGGAGAAAGGGCAAGAAATTCTTGTGCTTATTAATTAA 0 0 5' arm Populus_trichocarpa mirnest MIR530 1e-45 ptc-MIR530b 5e-47 -58.8 ..((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((........)))))...))))).))).(((((((....((((.....)))).........)))))))(((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))).)). (-58.8)