mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTATCTGCATTTGCACCTG GGTGCAAGTGCAGGGTAAATGC TTGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTATTGCGTTTGTTTTGTTTTTGACTCCGACAAACAAAATCAAGTTCTGTCGATACAGTATGTGGGACAATTAGATATGGAAACTAATAAGCTTAGTTGAGGTGCAGGTGCAAGTGCAGGGTAAATGC CTCATTGTATATAATACTACTAGTTATAGAGAGTGAGTGACAACTAGTAGCTAGCAGTTGTTTGATATAATATGATAAACAGGCTGCAGGTCATACAGGCAATATTATGCATGCCAATATGTTGCCTTTATCTGCATTTGCACCTGCATCTTATTGCGTTTGTTTTGTTTTTGACTCCGACAAACAAAATCAAGTTCTGTCGATACAGTATGTGGGACAATTAGATATGGAAACTAATAAGCTTAGTTGAGGTGCAGGTGCAAGTGCAGGGTAAATGCCATTTTGGTAATGTTTTCACTCCCATATATACACAGCAGTGCTGGCCTCTTTTCTTTTCATCTGTCTGTGGTTAATTTGCAGTTTCATGGTGGCAGAAATA 1 1 5' arm Populus_trichocarpa mirnest MIR530 3e-70 ptc-MIR530b 2e-71 -51.9 ..((.((((((((((((((((((((((((((.(((.(((((..(((((((..(((.((((((((........))).)))))....)))....))))))).))))).))).((((((.....)))))))))))))))))))))))))).)))))).)) (-51.9)