mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAAATGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA GCGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGATCTTCCCGCGCGTAATGGATGCCGTTGGCGGCGGCGAATTTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAATCGGAGGCCACG CCTTTTGCCGGGGACCCGTTCGCTTCATACTGTGGTAGTGTGGTGTGAGTTTGGTTCCTATTTTTCACTTTAGATTCGAGATTTATCTCTCTGGAAGAGAGAGAAATAAAGAGAAGCTGCGGCTTCTGTGTGTTGTGGTTTAGGGAAGAAGCTGCGGCTGCCATAACGGCGGCGACTACGGTGATTCTTCTTTTCTTTCTCTCACTGCGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGATCTTCCCGCGCGTAATGGATGCCGTTGGCGGCGGCGAATTTGGATCCCGCCTTGCATCAAATGAATCGGAGGCCACGGTGAAGATTCCGGACGTTTTCCGGCGAGTTTCACT 2 0 3' arm Arachis_duranensis mirnest MIR168 0.000000000002 gma-MIR168 3e-20 -56.5 ....(((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((..(((((((((.((((((...)))))))).)))).))).)))).))))).)))))))))).))))).)))))))... (-56.5)