mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTATAGCATCATGAGCAATCA ACTGCTCATGATGTTATATCA CACACTTTATTCAGGAATGAAGTATAGCATCATGAGCAATCAGCCTTAAATTTTTTTTTTAGCAAATTGACTGCTCATGATGTTATATCATTTCCATGAATTTATCTC GGCAAATTCAAATGATTAATCATACAAATATTGCATATACATTGAAACATAACGCATTAGTACGTAGCACCATCTTACTTAGCTAACGAAAACAAAAAAAACTAAGCTTGATTTGCATGAATTATGAAGTCTTCTAAGGGCTGGCAAATACTTGTCAGTGCTAGCTAGCACACACTTTATTCAGGAATGAAGTATAGCATCATGAGCAATCAGCCTTAAATTTTTTTTTTAGCAAATTGACTGCTCATGATGTTATATCATTTCCATGAATTTATCTCTCTGCATGCTACCATATCTATATGTAAATGCTGCCCTAATTGTAAAGTTGTCCTAACGAAAGCCCCCTCCTAGGGCAGGGGCCCAATAGTCTGCTCCATTGTCACTCCCAACTTGCAGTGGGCATGACACAGGAACCAGACACAACCCTCTACTCCTCAGCCCCTTCTGTTGTTCTTCCTGAGTATCCGGTTCTCCTGCTGCTTTCCTTTTCAAGCAGTTCTCATTCAGCAGCTGACCAGGGTCTTCAGGGAATATACAATTCTTCTCTCCTTGAACAGAATTCTGCTGCCTCCCATTCCCTGGTCCACCACTCAAGTATGGTAAGCTAAGGGCCTCAATTTGACTCTGAAGGAATCTGATATACCCAATAGCTTCTAACAAGACAGAGGCTGTGTCAGTCTTCCCAAATGGGGAAACGAGCTGATGAAAGGGCAGTAATTCTGTCACCTAACTTCTCCTTCCTGACCTTGAATGT 2 0 5' arm Phaseolus_vulgaris mirnest 100 100 -32.5 ........((((((((((((..((((((((((((((((.((((..(((((.......)))))....)))).)))))))))))))))))))))))..)))))....... (-32.5)