mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATTGAGCCGCGTCAATATC TATTGGCGCGCCTCAATTTGA TTTGGTGATGGAGAAGTGTTATATGAATTGCACAAGCCAAGGTATTGGCGCGCCTCAATTTGAAGACATGGTTAACAGGAAAACCAACCATGTAGTTTTAATTGAGCCGCGTCAATATCTCATCTTGCACTTCTTTCCATCTCCAACCCCTCAAACTC GACGATATATCTGTTTTGTTTTTCCCCTTCTTCATGGCTGAAATCAGAAGCTTGGAAACTAAACCAAACCAGTTCTAGTTCAACCCTCCAACCTACCCTCTCTCATCACTCAATTTTCATGTTATATATCATACCCTTTAGTCTTTTCTTCCTACCAAGATCATTGAGAAAGCAAAGAGTGAAGAAAGTGGCACAATCAACATCTTGGTATGGCTCTCATGGCGAGAGGAGAAAGAATCAAAAGGGTGATATTTGGTGATGGAGAAGTGTTATATGAATTGCACAAGCCAAGGTATTGGCGCGCCTCAATTTGAAGACATGGTTAACAGGAAAACCAACCATGTAGTTTTAATTGAGCCGCGTCAATATCTCATCTTGCACTTCTTTCCATCTCCAACCCCTCAAACTCAAATCCTCTCTGGTACGTTCATGGTATTTGTTCAATCTTCATGTTCTTTTCCTTTTTTTCTTGATTACACCCTTGTCCTCAATTATTCTCCCTAGTGTTACACATTTATTTCGGTATGCAGTATAAGGTTTGAACCTATATAATAACTTCGTGTAAAATTTTCAATCTGACCACTAGGTCAACCTAGTCGGTTATATATACACATCTGTTTTTTTC 2 0 3' arm Phaseolus_vulgaris mirnest MIR171_1 0.0000000000002 ctr-MIR171 0.0000000005 -52.9 .((((.(((((((((((((...((((...((....))...((((((((((((.(((((((.((..((((((((............))))))))..))..))))))).))))))))))))))))...)))))))..)))))).))))............ (-52.9)