mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA TTCTATCACTGTGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCTGTTTTTGCGCGAAATGGTGGAGTGGTTGCCGGCGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCCGCAGTGAAGGTTT ANTGGGTACGGGCCCCCCCTCGAGGTCGACGGTATCGATAAGCTTGATATCGAATTCCGTTGCTGTCGGTGGGTTGGGGTTAGCTCCGCATTCTTCAACACTTTCTCTCTCTTCCTCCTTTTGATGTAGAGAGAAAATAAGAGTGTGAGAAATTTGTTTGGTGGTTTACTAGTGGAGTCGATGCGATTACGTTGCAGATTTTGATTCTATCACTGTGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCTGTTTTTGCGCGAAATGGTGGAGTGGTTGCCGGCGGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGGCCGCAGTGAAGGTTTGTGTGGTTATCCGGTGCTCAGATCTCATCTCCCAGATTCTACTACCAGTAAATCTTTTCCATTTTTTTAATTTACTTCGATATCTGCTTATCAGATCCAGTCATAGATCCCCGATGCATAGAGTCTACGTCTTGGGAAAACATTTTTTCTGTAAGCTTCTGCTGTGTTTTGTCCTTGTTTGGATTTTTTTACTACTTTGACGTGCTTTGTTTCATTGATTATGAGGAAAAAATCATATTCAAACTAAAATAATCATGGATGTCGCTATAAGGTATGTGATTCAGTGATTTCAATTTGCTTGAAAATAAAAAACAGAAATTGTTTGAGTTTTTTTCTGACTCTGTTTGGGCTTTGGTTGAATTAGAATGGATGTTATAGATGCAAAGTTTAAGGTCATGCATTTTATTGTGGTGCTTGTGCTTATCCTAATTCATGTTATTTCAGATTGTTTGATACTTTTTGTTGGAATGGAAGGTTTAAGTTTATGAAGCAATTTTTATGGGTGAACTTCTAGAATATAAAGCAGGGATGAAAGGCTTGATGGGGGTTGTGGGTCTCANGGTCATCAATTTTTAGACTAGACATTCTTAATTTA 2 0 3' arm Phaseolus_vulgaris mirnest MIR168 2e-18 gma-MIR168 4e-47 -63.8 ..((.((((..((((((((((.(((((.((((((((((.(((((.((....(((((.((...((((((.....)))))).)))))))..)).))))).)))))))))).))))).)))))))))))))).))... (-63.8)