mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCTTAT AATTTGTGAAGGTTATGATG TATTCCTTCTCTTCTTCTTCATCATCATCATCATCATCTTATCCTCCTCCTCCTTTTCTTCATGTTCTTGAAGAACTAGAATTCATGGCAACTAACTGTAGTTCATCAGCTCAAATCTCTCTTCAGAAATATGGTTCGTTTCTGAAATATGCCAACAAAGATTTGAAGCCCAAAGACTGCTCTGTCCCACAGAAAAGAGCTGCAGGTGGTCCAGTAGCATTGAGAATCACAGCATCCATCAAGAACAAGATTTATGAGGACAAATCACAGGGCATAGTTGCTATGAAGATGAGAGTGGAGAAATAATTTGTGAAGGTTATGATGAAGGGCCTCGTTATCATC GCGGGGATTGTACTATAACTATATATCAATTAGCCATCCATCAACACTTTTATTCCTTCTCTTCTTCTTCATCATCATCATCATCATCTTATCCTCCTCCTCCTTTTCTTCATGTTCTTGAAGAACTAGAATTCATGGCAACTAACTGTAGTTCATCAGCTCAAATCTCTCTTCAGAAATATGGTTCGTTTCTGAAATATGCCAACAAAGATTTGAAGCCCAAAGACTGCTCTGTCCCACAGAAAAGAGCTGCAGGTGGTCCAGTAGCATTGAGAATCACAGCATCCATCAAGAACAAGATTTATGAGGACAAATCACAGGGCATAGTTGCTATGAAGATGAGAGTGGAGAAATAATTTGTGAAGGTTATGATGAAGGGCCTCGTTATCATCGAATTCCAAGTCCAACTCATCACCCAAGGGATGTTGAAATCATGAATCTTGTGCAACAACAAAGTTGGCTTCAGATTGTTAAAGGGGAAGAAATCAATCATTTAGCTAAAGGAGTTCTTCGTTCACGAGAGGATTTAAACTACAACAGATGGATTTAACTTGTTCAAAACCAATCAGGCTTTTGTCACTCTCAAAGGCCTTAACAATTACATGCAGTGCTAATATGTAGCAGAAAG 4 1 5' arm Phaseolus_vulgaris mirnest 100 100 -77.8 ..............(((((((((((.(((.(((.((..((((.((((..(((.((((((....(((((...))))).))))(((((((((((((.(((........))).((((((((...(((((((((.......)))))))))............)))))))).((((...((..(((((.((.....))..))))).((..((((((((((...)))).).))))).)).(((.(((.(((.....))).))))))....))...)))).))))))))))))))).)))...))))..))))..))))).))).)))))))))))............. (-77.8)