mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG GGCTAAAGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGATGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATAAGCAGAGATTATAATTTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTGTATTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTCTCTC TTCATATTTATATATATATTATATAATATAATATGTGTGGTCATAGTAGCTCGAGTCTGTGAGGTTCATGTGTGGTTGCAGATAACCAGTTCGGTATTTTACCTTTAGAGAGATCAAATGAAGGATTAGGAGTTGTTTAAGCCAGAGATAAGCTTCTGAGTAGTTCCAGATTTGTTGGGATTTTAGTTCTTCTTTCTTTCCTGCTTTTCTCTCTTAACAGAGAAAGTGTGTACGATTAGATCTATGAATCTGGATGAAGTTAATCTCAAAACTAGGAAAAGGGGAATGGGGGTTTTGAAGCGTACATTTGGATTTGTTGCAGTTGATTTTATTTTTTATATATTAGGGTTTGTTTTCTGTTTCGAAAAACATTTTACCATAGTTAATGAAATTAAGTAGTGATTAAGGCTAAAGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGATGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATAAGCAGAGATTATAATTTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTGTATTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTAACATTTCTTTCCCGCACTTAATTTCAGTCTCATATATGCTTCTTGATCCACTTTTGTTGTTGTTTTTATCTGGTTCTTTGATTTTTATAACCAAGGATCTACTGTTAGATCTTTGTAATGTTTTGTAGTTTGCGTCCTTGTTGTTTTTCTCTGCATTTATTATTTTTCTGCCATTTCTCTGGTGCCTTTGCC 3 0 3' arm Ricinus_communis mirnest MIR159 3e-105 rco-MIR159 2e-99 -75.6 ......(((.((((((((((((..(((((((..((((((((((..((((((...(((((.(((((.((((....((((((.(((((...(((((.......))))).))))).))))))....)))).))))).)))))..))))))..))..))))))))..)))))))..)))))))))))).)))..... (-75.6)