mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure NGAAGCTGCCACATGATCTGA AGATCANGCTGGCAGCTTCAAC CAACCAACAGGNGAAGCTGCCACATGATCTGATCTTTCCTCAACCCAAAAAAGGAGGCAAGTTTAGATCANGCTGGCAGCTTCAACTGCTAGAG TTAGCATAAAACTATGTAAACAAATCTGGGCTTTTCTCAGAATTTGTTATGGCTCACCAGTCACCAAAAACATTCTAGGATTCTTCAAATCATGCACAGAATAACAAAAAACATCAAAACACATACAAATTATGATTTCTAAACATCTAAAGAATCAGATCTACCCTTCTCCCACCAACACACATACAAAACCCTAATTGTTTCCATCAATTCAATCCACACAATTGCAGAAGAACAATAGAGGGCTATAGAATTCATGAAAAACCGAGATCTTGATTATAAAGAAAGTAAAGGAAAAAGCAAAAAAAAAACATTACCCTTTTCANGGTTGGGAACAAAATTATCTAGGCAAGTAGGGTTTGTGAGAAATTAAGGTTTTTTCGNGCAACCAACCAACAGGNGAAGCTGCCACATGATCTGATCTTTCCTCAACCCAAAAAAGGAGGCAAGTTTAGATCANGCTGGCAGCTTCAACTGCTAGAGGTGCACGGCAAAATTACAAGCATGCCCTTGTAATTCCATACTAGCAAAAAAAAAANCCTANNCTATAAG 3 1 5' arm Ipomoea_nil mirnest MIR167_1 0.000000001 sly-MIR167 0.00000000007 -37.9 .......(((..((((((((((..((((((((.(((.((((............)))).))).))))))))...))))))))))..)))...... (-37.9)