mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGATGTTGGCTGGCTCGATG TCGGACCAGGCTTCATTCCTC ACGACGAGGAGGAGATATGAGGAGTTTGAGGGGGATGTTGGCTGGCTCGATGCACTTACTTATCATCTTCCTCAAAAACATGCGACATATACATACATATGGAAGATCATATATCTATAAATATATATTTGTCTTCCATATCCCATATATATATGTTGATGATGGTGGAGTGATGGCATCGGACCAGGCTTCATTCCTCCCAAAACACCCATATTTCTATCTGCTCT AGTAAACCACTTTCTCTAACAAAAAAGCCTAGAGAAGTCGTCGCAGCTATCTGGAAAGTGCGACGACAATTAGGTTTAGGGTTCGTTCGTAGGTCCGCTTTACGCGACCGACAACTCAGAGAACGTCGACGACGACGAGGAGGAGATATGAGGAGTTTGAGGGGGATGTTGGCTGGCTCGATGCACTTACTTATCATCTTCCTCAAAAACATGCGACATATACATACATATGGAAGATCATATATCTATAAATATATATTTGTCTTCCATATCCCATATATATATGTTGATGATGGTGGAGTGATGGCATCGGACCAGGCTTCATTCCTCCCAAAACACCCATATTTCTATCTGCTCTTTCAGGTTGTTTCTATCTACATGGCTTCACGCCGGAGGCCGGCCGGCCGGTGAGCTGGTTCTTGTTTTTCCGATCCCTTTGCCCTTTTGTTATGCAGATTAAAACTTAGTTAACTCTTTTTTTTTTT 2 2 5' arm Ipomoea_nil mirnest mir-166 0.00001 mtr-MIR166c 0.000003 -71.9 ......(((.(((((((((.((.((((..((((((((..((((((.(((((((..((((((((((((...............(((((((((.(((.((((((((((.((.((((.((....)).)))).))))))))))))....))).)))))))))..)))))).))))))..))))))).))).))).))))))))...)))).))))))))))).)))..... (-71.9)