mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA ATACGTTGTCGTGTGTTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTATCGCCGCGCCGGCGGCTGAGCGAGCACGGTTGCGTCGTCGTCTCCGGCGAATTTAGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCGCGGTGAATTGTTTGTTGTCTC GACCCTCTCTCCTCTCCCTACCTAGCCCCTATACATAGCCTTCTCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCTCTCTAGACTTCCAGATCTGTGAAGGCGAATACGTTGTCGTGTGTTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTATCGCCGCGCCGGCGGCTGAGCGAGCACGGTTGCGTCGTCGTCTCCGGCGAATTTAGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCGCGGTGAATTGTTTGTTGTCTCTCGAATCCTGTACGCGCGAGTCAACTACGTATTGGACTCGTCTTATCTCTTAGGTTTGGATTTGCTGAATTTATAACCGTTCTGTTTGTTTATTTATTTATTTACAGTATTTATTTGTAGAAATGAGCATGGTTTTCTCTGGATCTAAATGGCTGGTAAGCTCCGCGTTTAGTCGCTTCTCTAGATCTTGCATTTATGTATAGTCAATTTGCTTCACTGGAGATTACAGCTGGAATTGTTATACTGTAAGTAATTTTAAAACAGGGACTTGTTTGTTTGCTCATTTTAATTCACATAAATGTAAGAAAACGGGATTCAGCTTAGCGTTGTTTATAGTTATCAAGCATTTTTGCTAATATTGTGTCGGGATTTTTCTTTTGTATTCATAAATATAAGATATGTTCTCTTCCTTACTCGGCGAATGTGATAGCAGAGCCATAAAGTTGGTGAAACACATACAGGTGAACAGCTTCTTTTTTCTCATGGA 2 0 3' arm Ipomoea_nil mirnest MIR168 7.0E-13 crt-MIR168 4.0E-14 -65.7 (((((....)))))((((((.((((.((((.(((((.((((((((((.(((((.(((......((((((.(((...(((((((....))).)))).))).))))))....))).))))).)))))))))).))))).)))).)))).))))))............. (-65.7)