mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT GTGTTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTATCGCCGCGCCGGCGGCTGAGCGAGCACGGTTGCGTCGTCGTCTCCGGCGAATTTAGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCGCGGTGAATT GACCCTCTCTCCTCTCCCTACCTAGCCCCTATACATAGCCTTCTCTCTCTCTCTCCCCTTTCTCTCTCTAGACTTCCAGATCTGTGAAGGCGAATACGTTGTCGTGTGTTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTATCGCCGCGCCGGCGGCTGAGCGAGCACGGTTGCGTCGTCGTCTCCGGCGAATTTAGCTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGCCCGCGGTGAATTGTTTGTTGTCTCTCGAATCCTGTACGCGCGAGTCAACTACGTATTGGACTCGTCTTATCTCTTAGGTTTGGATTTGCTGAATTTATAACCGTTCTGTTTGTTTATTTATTTATTTACAGTATTTATTTGTAGAAATGAGCATGGTTTTCTCTGGATCTAAATGGCTGGTAAGCTCCGCGTTTAGTCGCTTCTCTAGATCTTGCATTTATGTATAGTCAATTTGCTTCACTGGAGATTACAGCTGGAATTGTTATACTGTAAGTAATTTTAAAACAGGGACTTGTTTGTTTGCTCATTTTAATTCACATAAATGTAAGAAAACGGGATTCAGCTTAGCGTTGTTTATAGTTATCAAGCATTTTTGCTAATATTGTGTCGGGATTTTTCTTTTGTATTCATAAATATAAGATATGTTCTCTTCCTTACTCGGCGAATGTGATAGCAGAGCCATAAAGTTGGTGAAACACATACAGGTGAACAGCTTCTTTTTTCTCATGGA 3 0 5' arm Ipomoea_nil mirnest MIR168 6.0E-13 crt-MIR168 3.0E-14 -64.2 ..((((((.((((.((((.(((((.((((((((((.(((((.(((......((((((.(((...(((((((....))).)))).))).))))))....))).))))).)))))))))).))))).)))).)))).)))))). (-64.2)