mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCATGATCTATCTGTCAGC GGGAGTGATAAGAGATAGAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCAAATTGTACCAATTTGTGTTGTATGATTGTTTTGGGTGCTCATGATCTATCTGTCAGCTTCTTCTTACTCTATTTC GGCGGGGGGTATTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTAACTGTGTTCTTTTAGTACAGAAAGAAACCTTAAATGTTTCTTTTTGTGGATATGCTGGTTGCATATTCACAGATCTGACTTGAAAAATGAAAACTAGTGTTTAAGGTTTTAGGGTTTGTTGTGATTTTTAAAAGTGGTTTTGGGGAGTGATAAGAGATAGAGTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGGCAAATTGTACCAATTTGTGTTGTATGATTGTTTTGGGTGCTCATGATCTATCTGTCAGCTTCTTCTTACTCTATTTCTGTATTTTCTTTTGTTTCTCTCATTAAATTTTATGTGTGTACTTGAGTACTTGATCTTGATTAGATTGGGGATAGGAGTAGTACTATGTTATCATTTTTGTTTCTTTTGTTGTTTTATCATAGTTAATTATTGGTTTTGTTGGTACACGTGTCTGGACGTGTTTTGATTGTGTTCGTTTGGAACAGTTGAACATAGAGGTGTGGTGGGGGTGGTTTTTGTTTTTGATTATTATAATTTCGAATTTGTTGAATCCCGATTGAGAAAATTAATAGCTTATTTGGACATTATTATATGTATTACTTAATTAAAGATAGGGTTTGAATTCCTGCCATATGAAATGCCACTTTTCATGGTTTACTGTGCTTAATCAAAGAAAACTGATATTTGATATATGACATTTGCACACTATTACCTTTTTGTTGGTATGGTCTTCCTTATTTTGTATTTTTTATATGCGCATGCAGATTG 3 1 5' arm Helianthus_tuberosus mirnest mir-156 0.000000007 ath-MIR156d 0.0000000004 -46.3 .(((((((.((((.....(((((((((((((..((((((((.(((((...((((((((((.....))..)))))))).))))).))))))))..))).)))))))))))))).)))))))..... (-46.3)