mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGTGGTTAGCTGGT CACTGATTGCACTGCCCATA TTGCGATGTGTGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTGTGTAATATAAACAACAACCACTGATTGCACTGCCCATACATCCGA CCATCAAAGGTTGAGTAAATAATGTTTTTTTTAAACTGGCAACCATTTCAATCGTTTATTGCCATTAATCGATACAATCAATGTTCACAGTAAATGGTAAAATCAAATCCTTGCTCGTTAATTTAATTTGGTTAACCTTTTATCTTTTTGTAATCCTTTTGGTTCAATTGAATAATAAATTATTAAATTTAAAATCTTTCCCTTTTCTTGCAACTAACGCCATTGGATCGTAACAATTGTAGCCAAATCCTTCGCTTATACTTTTCCTCCAAATGATTACTGTCACCAAATCTGCTCTTTTTGTACTTTTCTTTATCCACAATGGTTGCGATGTGTGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTGTGTAATATAAACAACAACCACTGATTGCACTGCCCATACATCCGATGCCGATCTCAACGTTGTATCCATAATTATTGTCCAACACAATCACCATTAAACTCGCTCTGTTTTGTCAGCTTTTGTTTTGTTAAACTTGATGACACAAGCAATGACTAGCAACACTTGAAAAGGATATCGCAATATTAATTAACATTTATCCTCTCCATTAATTGTTAACTTGTAACCTTGGACCAAAGCGTTTATTCACAATTCATCTTCATTGTTTCATTTCATTTTGCTTCACCATCACCATTATCATCATATCCATCATCTTTTTATCTTCTAT 0 2 5' arm Tetranychus_urticae mirnest mir-449 0.000001 sko-mir-34 0.00000006 -35.2 (((.(((((((((((((((((((((.(((((((............))))))))))))))))))).)))))))))))) (-35.2)