mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGAGAATTGTGTAATCCTTA AGAATTATTCTAATATTCTTCT TTTGTATATTTAATTTTTCAAAAGAGAATTGTGTAATCCTTACGCCAGAAAGAATTATTCTAATATTCTTCTTAAATTAAAATTAAAAGT AAGATTGTCATTTACCTTTATTTTGATAGACATGTAATATTTTAGTCAATTTTTACATATATTGAACATCAAAAAAGTAATATAGGAGTAAAAAATAGGGTATAAATTTGTATATTTAATTTTTCAAAAGAGAATTGTGTAATCCTTACGCCAGAAAGAATTATTCTAATATTCTTCTTAAATTAAAATTAAAAGTTACTGAACGATGGAATTTGCGAAGAAGATCACTTTAGGGTTTGTGCGCGGTTTTTGGGATAGCATTAAAGGCATGACATTTGTTTTTTATATTGATGCCGAAGTAGCGGAACAAGAACGCCAGAATCCAATGCGTCGCAGTCCATCGCCAGTACCTTCCTCGCCTTCTGAAATGATTATGGAGCAAGAAAGGCAGCGCGATTTTCAACGAGAAAATCCTGATG 4 1 5' arm Glossina_morsitans_morsitans mirnest 100 100 -10.9 ........((((((((.....(((((.((((.(((((.(((........))).)))))..)))).)))))...))))))))......... (-10.9)