mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTAGTTTTTTGTGGTTTTTA AAAATAAAAAAACTTTGAA CTCTAGATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTTTGTGGTTTTTATTGAAAATAAAAAAACTTTGAAATAATATTTAATAAAATAATACGTGCA CTCTAGATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTTTGTGGTTTTTATTGAAAATAAAAAAACTTTGAAATAATATTTAATAAAATAATACGTGCAAGTTATATATAGTTTTAATATACGGTTGGGCTTTGAAACTAAATTTATGCCATTTATTAAGTGTGACTGGCGATTGACTAAAATTAAGGTTAAAATATTGAACTTATATATTAACTGCAAGAAAATAGGTGATCAGAAAATTGAATAAATTGTGACATTTTATATAAAATATGAGAATTTCACAATACCTATGGAAATAGATAGATACAACACATTCAAAGAAGAGAACAGAATAAAAAAATAGTAAAACAATAAAGTATATTTTTCGTACAAAGATGAATATTAATTATGTTTTTTTTTTTTAATTTTTTAAACCTTTTTTGCGTTTTTCAAATATTTTAATTTTTAACATTTTTGTCTTCTTCTTGATGCTTTTTAAAGTTGATTTTTATTCTCAAATAAGATACGATTAATTT 4 2 5' arm Glossina_morsitans_morsitans mirnest 100 100 -13.3 .........((.((.((((.((..((.((((..((((((((...((((((...)))))).))))))))..)))).)).....)).)))).)).))..... (-13.3)