mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACCCGTAAATCCGAACTTGT AAGACCGGCATTATGGGAGTCT CGGCCGGGACCCGTAAATCCGAACTTGTGCTATATGCTAATTGTTACAAGACCGGCATTATGGGAGTCTGTCA CGGCCGGGACCCGTAAATCCGAACTTGTGCTATATGCTAATTGTTACAAGACCGGCATTATGGGAGTCTGTCAATGCAAACAACATGATGTATAGTTTCTTGTAAATCGATGTTTTGTTTTACGCTTTATTCTGTTCCTCTGTCTCCCTCTCGCTCTCTTTGTGATAAATGTTTGCCACACAGGTTTTTCAAGATAAATATATATATTCCTTCCTTTTTTTTTTTGCAAAATGTTAACAAAAACAAAATAAAAAAAAAAGCAAAACTTACAATTATTAGGTTTTCCCTCCGCCTCTTTTCTTAAGAAGCAGACTTATTAATAATCATTAAATGGAAAAGCAGAAAAAAAAGTAAAGGACCAACGAACCAGCCTACCATCATCCCTCTGGCAAATTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTAGTAAATTTGAAAACATTAAACATACTATACAACGTGCTAGCTTTCTCTGCTTGACTATAAGCAGCAGAAAATCGTTTTGTAACAAAAATGATTAACGCCTTACCCATGAAACTAAGAAGACGAGCAATGTAAATAAATAGCAGCAGCAACAACAACGAAAACAANCACAGCAACAACAATAACCATAAACATATAACATACATATGATATAAGTTTTTGAAAATGAATTACG 5 1 5' arm Glossina_morsitans_morsitans mirnest 100 dan-mir-100 6e-17 -18.4 .(((.(((.(((((((..(((..((((((.((.........)).))))))..)))..)))))))..)))))). (-18.4)