mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCGTCATCGTCTTCATCGTC CCATGCTCGATAATGAATT TAGTAAATGCGACCATGCTCGATAATGAATTCTTCGTCATCGTCTTCATCGTCATCATCATC GCCGCCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGGAAATTTTTATTTATTTTTATTTTTATATTTTTTGTTTCAATTTGTGGCTAATTGGAATTTTACACAATCTTGTGTTTCTTTCAATAATACTTTACTTTTTTCTCTTTTTCTCTCTTTCATTATTTAGTTTTCTTTATAAAAGTTTGAAACAAACAAAAAAAAAATCTATTAATATATAGGTGTAGATAGAGATATTTTTTTGTATGTCGCATATTATTATTATATCATATAGGTTATCTATAGTATTTGTATTACAAATGGTTAAAAGTTTAACCTAAATCGTATAACTTTCGATTTTCTTCGCTTCTCGGAAACTTCTTTGCTTGTTTGTTGTTTGTGTCTCTCTCCTAAACAAAACAGATAGTATTTAAAATGATTTCGCAGCTTTTCCTCCCACTCTCCCGCTCTCCCGCACTTTTAATCATTGCTTTCCCACCCACTTTTATCATTTAAAGTTTAGACTACACTAATCGGAGCATAACGATGCACTTTGGGTTGTTTGGGCTCTTTGGGCGGCTTGATTTCTTCGCTTAGTTTCTGATAGACTATTGAATTTTTATGGGCTTGCAGCAGAGACATGCGATAGCGTTCGCCACGTTTCCGCATAACCATCGATACCACTTTAGCGATGATCAGTAGTAGCAGTAGAACGCTAGTTACTATAATTATGATGGGTATCATAAATCTGTAGCCACTGTAGTAAATGCGACCATGCTCGATAATGAATTCTTCGTCATCGTCTTCATCGTCATCATCATCATTGCTGGTCTCTTCTTCTTCGTCTCGGATAATATTGTTCAAATGTTTCTCTTGTTGAGCTAAGAATTTACCCAGTAAATATTTGTT 4 2 3' arm Glossina_morsitans_morsitans mirnest mir-598 0.000003 mml-mir-598 0.0002 -11.7 ..........(((.(((..((((.(((((...))))).))))....))).)))......... (-11.7)