mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGCTGCTGCTGCTGCTGTA CTGTCGCCGTAGCAGTCACTT ATACCGTTGACGGTCGTTTGCGCCGATTGTTGAGTTTGTGCCACTGTCGCCGTAGCAGTCACTTGATTTTGTTGCGTTTGATGATGAGGATGGATAGGATGTTGCTGCTGCTGCTGCTGTAAATGGTTATGAGCCATCGTTACCTGCGTTGTATGCTGCTG GCCGCCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCACCTTAAAGGCTTGTTATTAATTACAACAGTTTGGTGGGAGAGCTTGAGAAAAAACTCTCTAACCATAACACTGATGTTCATAATGTTGGCGATGACATTGTATGTAATGATGACGATGATGATGATGAGGATGGTGATAATTTTGAGGATAATTTTCCATTGAATAATGATAATGTTCAGAATAATGTTGTGGCCTTTGCTGCGCCCATATATCGGTCACAGATTCCAGCGCAGAGTGCGAAGAATGCAACCGAAACAAATGCATTGCACAATGCTGCCACCATAAATTTCAATCTTTTTGCTGTTGCTGATAATGACCGCCGCCACCAGCTCCGCTAATACCGTTGACGGTCGTTTGCGCCGATTGTTGAGTTTGTGCCACTGTCGCCGTAGCAGTCACTTGATTTTGTTGCGTTTGATGATGAGGATGGATAGGATGTTGCTGCTGCTGCTGCTGTAAATGGTTATGAGCCATCGTTACCTGCGTTGTATGCTGCTGCTGATGATGCGTACTTGTAGTCGACATAGATGTTTGTATTTGGTGTGGCGCTAAGATAGTGCTGTTGCTGTTGTTATTGCTATTGCCATTCACCGTTGAAGACAATATGCCACTATTACCGTTCATGCTAGTCATAGCTTCATTTTTATTATTGTTGCTAGCATCCCGTGGTAGTAAATAGATGGATCCATCCGATGCTTGCTGTAAACTGTACTCTGACGTTGAACAAGGATTGC 5 0 3' arm Glossina_morsitans_morsitans mirnest 100 100 -39.2 ..((((....)))).....((((.((((....)))).)))).((.((.((.((((((((.((...((((((((.(((((........))))))))))))))).)))))))).)).)).))....(((.((((....)))).))).((((...))))..... (-39.2)