mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
TTTGTTTTGTTTTTTGTTTAA AAAAAAAAAACAACAACTAAAT GTTTCCTTGTTTAAAAAAAAAACAACAACTAAATCCCCACCAATGTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAGCAAGGC TGAGACAAGGCCCATTGGTATGCCCCCCTCCCAGTAATAGTTAATTTTGAATAATTGTGTATTGTCTGAAAAGTGATGAGTGCTAGTTTTTGTTTCCTTGTTTAAAAAAAAAACAACAACTAAATCCCCACCAATGTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTAAAAGCAAGGCATGCTTGTGATGACTTTGTAACAGACTAATTCAAATTATTTTGTTTGCAGGTTCCAATTTTAAAAAATGTTTAGGTAATCTCCTTCCCCAGTCCTAATCTTGTGAATTCGTCAGTGCTGAACCAATGCTTTCTTGTGTCTCAGTTCTTTGTATATGAATTCTTTTCAGATGTATTAAACAAACAAAACCCTGC 2 1 3' arm Peromyscus_maniculatus_bairdii mirnest  100  100 -16.5 ....(((((((((((.(((((((((.(((.((((..........)))).)))))))))))).)))))..)))))). (-16.5)