mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTCCCGAACCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCACCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTCCTCACGGGGCCTT CGGCACTTGCACATGGGTTAGTCGATCCTAAGAGTCGGGGGAAGCCCGACAGAGAGCGCGTTCAGCGCGAACTTCGAAAGGGAATCGGGTTAAAATTCCTGAACCGGGACGTGGCGGCTGACGGCAACGTTAGGGAGTCCGGAGACGTCGGCGGGGGCCTCGGGAAGAGTTATCTTTTCTGTTTAACAGCCTGCCCACCCTGGAAACGGCTCAGCCGGAGGTAGGGTCCAGCGGCTGGAAGAGCACCGCACGTCGCGTGGTGTCCGGTGCGCCCCCGGCGGCCCTTGAAAATCCGGAGGACCGAGTGCCTTCCACGCCCGGTCGTACTCATAACCGCATCAGGTCTCCAAGGTGAACAGCCTCTGGTCGATGGAACAATGTAGGCAAGGGAAGTCGGCAAAATGGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCACCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGCTCCTCACGGGGCCTTCCCCGGGCGTCGAACAGTCAGACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCTGCGGATGCTAACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTAGGATAAGTGGGAGCCGGAAACGGCAAAAGTGAAATACCACTACTTTTAACGTTATTTTACTTATTCCGTGAATCGGAGGCGGGGCACTGCCCCTCTTTTTGGACC 5 1 3' arm Actinidia_chinensis mirnest 100 peu-MIR2911 3e-39 -73.3 ((((...((...)).))))..(((((((((....(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).))))....)))))))))..((((((....)))))).. (-73.3)