mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGCAAAAATTAGTTTCAAG TGAAAAGAATATGCAGGCT AAAGGAGGAAGTCGGCAAAAATTAGTTTCAAGAGTTGGGCTTGAGGTAATATTAGATATTATCCAATATTGCGACATTTGCCATCAGATGTTATATTTTTCACAAATCGAACAGCTGTCATGGCCACTTCAGGCTTTTATTTTGAAAAGAATATGCAGGCTGAGCTGTC AAACGGATGCAGAATACTAAAACTTTAACTGCATTTTAAATAATACTGCAGCCACCATCTTTTTAGACAAAAAACTTGTTGCTCAGACAGAGAAAAAAAGCCAATTTCCACCCTGACGTGTGTTATTTCCAGCTTGTCCTCATCAGAAAAAACAACCATGAAGATCGACTGTGAAAGCAGCTTATTTAAGGTTCTTGTAAAGTGGCGTCCTCTAGTGGCCGTACCTATTATTACGACAGCAAAGGAGGAAGTCGGCAAAAATTAGTTTCAAGAGTTGGGCTTGAGGTAATATTAGATATTATCCAATATTGCGACATTTGCCATCAGATGTTATATTTTTCACAAATCGAACAGCTGTCATGGCCACTTCAGGCTTTTATTTTGAAAAGAATATGCAGGCTGAGCTGTCGTGGCAGCGGAGGCAACATGCATCCATACTTGGG 4 2 5' arm Sparus_aurata mirnest Intron_gpI 0.0006 100 -40.2 ......((.((((.(((...(((..((((((((...((((((((((((((.((.((((((....))))))..)).))).((((((((.((((..((((.....))))..)))).)))..))))).)))))))))))...))))))))..))).))).))))...))... (-40.2)