mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTAGTCTGCACATTGGTTA CCCAGTGTTCAGACTACCTGTT CCCCCCGCCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCATCAGGCTACAGCTGAACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTGGGC TTCGCTTTGCTTCTTCGGAAAGGCGACTGACATGAAAATGCACTGTTTCCAGTCGGGGTTTGGGCACACTAAGGCCAGTGGACCGGAGCTCATCCTTAGAAATTAAGTGAAGTAGTATCTTTCAGTGGTCTTATTTCGCTGGGAGAATGGATATGTCTGAGGCCTTGGAAAGGAGATCAAGTGGTGAGTAAAGCAATAATGCTATGCTTGCATTCTACGCATTTTTGATCATTGCAGACAGTTCTGAAGTTAGTTTCATCAGTTTTTTATAATTAATTAGATCATGTAGACTTTATCAATCAGCGCACCAACAGGTCACTTGTTCTGAATGTTAACCATCAGGTCAGTGAATACAACCTTTGAAAAGGTCTATAATGTAAATAAACTGTAGAGCTGAGTCTGTTGCGTTTGTGTAAGTTATTTCCTCAATACAGTCCAAACATTTGTCGATCTATTTGCATAAACCGTTTGAAATCATCGTTGCAGAGATTGGATTTTTCATATTCACCTCTATTTAAATTAATATTTGGTTTTGTTTCAGCGTGTTCAGCTGTTACATGAACGTGTTTTTTTTTCATACGTGCAATTGTTTCACTGTGGTAATGTTTACTCTTCATGCCCTCTGTTCCAGTGTCCTAGGGTAGCGACCTGAAGCCGCATTGACCTCAGGGTCCTTCCTCCCATCAGAGTCCTCCTCACCCCCCCGCCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCATCAGGCTACAGCTGAACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTGGGCTGGGACGCACACACCTCCAGACACCAAATCTCCACTTGGGATAGCTTATCCCAACAGTGTGAAATTCAGCGTTGTCATCTTTATACAT 2 1 3' arm Sparus_aurata mirnest mir-199 4e-34 dre-mir-199-3 1e-30 -38.3 ..(((.(((((.(((((((.((((((((.(((((....(((....)))))))))))))))).))))))).))))).))). (-38.3)