mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGGTAAAATGGAACCAAAT TTGGTCCCCTTCAACCAGCTG ATTCCACAATGCTTTGCTAAAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCACCTCTTGAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTATGCTTTGATGAC AGTCACCTTACGGTGCAGACTACCATACTTGGGAGAGAGAACGGTGAGGAAAAATATTCTGCTCATAACTTCCTGACCTTGGCGAAAGCAGCTGCCGTGTCCGTCTCAGAAACAGTGATTCCACAATGCTTTGCTAAAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCACCTCTTGAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTATGCTTTGATGACTACAAGGAGCTCCTTTTGCTGTGATGCCCTCAACACAATCACTGCAATGACAGCAGGCCGCTTCTTGATGATTCTCGACCAACAACATCTGGAGTGTATGGTGATTTTCATGTTCAATGCTAAAGCTGTCTGATTTTTGACTAATAAATAAACCAATCCCAGCTTC 4 0 5' arm Sparus_aurata mirnest mir-133 2e-27 dre-mir-133a-1 8e-45 -32.9 ......(((.((...((((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).))))...)).)))..... (-32.9)