mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGCGTGTACATGTACATGTA CATGTACATGTACATGATGA TGTATGTTCGTACATGTACATGTACATGATGAATTTCAGCTAAAACAGGGCCCATGCGTGTACATGTACATGTACATGTATAG GGGTGCAAATAAATTCCATGTGACACTTGAGAACTGTTTCATTATTACACATTTGTATGTCAAATATTTTAATCAATTTTCTAAATCTTTTATTTAAATCTTTATGAGCACATGCATGCATAAGTACATGCACATGCATGTACATGTATGTTCGTACATGTACATGTACATGATGAATTTCAGCTAAAACAGGGCCCATGCGTGTACATGTACATGTACATGTATAGGCTGGTTCAATTCAGACAGTCATGAGTCATTGTATTAGAAAAAAATCAGGAATCAATCTCAATTTTTGAGCATGGACTTATACATATACATGTACATAAATTTTACAGAAATTACATGTACTGTACATGTAGCAAAATTTTTTCAGATGG 0 1 3' arm Amphimedon_queenslandica mirnest 100 100 -30.3 (((((((..((((((((((((((((((((((.......(((.......))).))).)))))))))))))))))))))))))). (-30.3)