mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGACGGAGAACTGATAAGGG GGTTGGTTTCTATCTGCT GGGTGGACGGAGAACTGATAAGGGGAAGTTACGCCGGGGATAACAGGCTAATCCTTTAGTAGAGTTCGTATTGGCTAAAGGGATTGGCACCTCGATGTTGAATCAGGGATAATAGCTTCAAGGCGTAGAGGCTTTGAAAGTAGGTCTGTTCGACCTTTAATACCCTACGTGATTTGAGTTCAGACCGGCGTAAGCCAGGTTGGTTTCTATCTGCT GGGTGGACGGAGAACTGATAAGGGGAAGTTACGCCGGGGATAACAGGCTAATCCTTTAGTAGAGTTCGTATTGGCTAAAGGGATTGGCACCTCGATGTTGAATCAGGGATAATAGCTTCAAGGCGTAGAGGCTTTGAAAGTAGGTCTGTTCGACCTTTAATACCCTACGTGATTTGAGTTCAGACCGGCGTAAGCCAGGTTGGTTTCTATCTGCTTTACATAAACTTATCTCGGCATGTACGAAAGGACCGTTGAGACTGGAAAAAGTAAATCCAGAAAAAAATTGCAGAATGATAATTTAATGCGCC 5 1 5' arm Crassostrea_gigas mirnest mir-184 0.0008 rno-mir-184 0.00004 -65.9 .((((((.(((.(((((((....((...(((((((((.((..((.(((((.(((((((((.((.......)).))))))))).(((...(((.(((.....))).))).))))))))(((((((((((.((..((((....(((((.....)))))))))..))))))))..)))))))))...))))))))).))..)))))))))).)))))) (-65.9)