mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTGTCTTGTGTTGCAGCC CTGCAACACAGGACATGGGT TGACCTGTTGGCTGGGCCAGGGGCTGCAACACAGGACATGGGTCCTGCTTCTCCTCCCCGCTCGTGTCTTGTGTTGCAGCCAGTGGAGCTGCCTGTCTTCC ACTACAGTGACCTCCCTGTTCAGCTGAAGTGTCACTGAGATCCAACAGAGTGCTTTTAACATGACAGGGTTATCGACCTTTAAGTCTCACTGCTGTGGCCTGAGCTGAAGGTGACCTGTTGGCTGGGCCAGGGGCTGCAACACAGGACATGGGTCCTGCTTCTCCTCCCCGCTCGTGTCTTGTGTTGCAGCCAGTGGAGCTGCCTGTCTTCCTCTCTGCCAGTCTGCCCACCGCTGATGGACTGAGCTCCCAGAACAGATGGATCCCACCGACTGTGGACCTGCCGACCCTGCTCCTCATGTCACGGCTAGCTCGT 0 0 3' arm Dicentrarchus_labrax mirnest mir-187 1e-37 fru-mir-187 4e-28 -46.7 .(((.....(((....(((..((((((((((((((((((((((................))))))))))))))))))))))..)))....))).))).... (-46.7)