mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGT TATACAGTCTATTGCCTTCCC TTGATTTGGACTCTGTCAGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGTGGGTGGGATTGCACCCTGCTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCCTGAGGAGCTCACTGAACA ACTTTTACAGCCAAGCAGGAAGAGACACAGGGAGCGATCGAAGAAGAAAAGGAGGAAAAGAAAAAGAGAGTTACCTTTGTGGATCTTTGATGCTGAAGCAACGTGGATGCTGTCCTTGGGGCTGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTTGTGTAACCTCTTTTTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCCAAGGAGACAGCTGAGTCAGCCACTCGCCGACTGTCATCTCCAGATGGGCAATCATGCTGTCTAATCAAAACATACGCTTGCAGCAATCAGCATAATGCACTGTGACAAGCATTGTTCTTTTTGCTAGAGCAGGTGAAATGGGTCATGTTCCCTAACAGGACGTGAGCGTGTGGTGTGTTTGATTTGGACTCTGTCAGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGTGGGTGGGATTGCACCCTGCTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCCTGAGGAGCTCACTGAACACTCATGAATGTTCGACACACTCACATGGCTAATTTATTCTCAGATCTCAGGAAAGAAATGAGCGAGTATCTATGTGTGCTGCTAAAGGTTAGCGATGCCTTGATTCAAGCTGTCAGATGAGTAACTTAAAAATATGTACATCTCAATAAAGTCATACTTGCCTCAAATCAGTTGTCCAAAAATCAGTGAAATAGATCTTGAAATTGTTTGTTCCT 1 0 5' arm Dicentrarchus_labrax mirnest let-7 9e-33 dre-let-7a-5 2e-27 -44.2 ......(((.((((.((((((.(((((((((((((((((((((...((((((((.......))))))))......))))))))))))))))))))))))))))))).)))....... (-44.2)