mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCCAGTGTATTGTTAGATGT ATTAAACTGTGCCTGCCTTGA TTCCTATTAGACATTAAACTGTGCCTGCCTTGATATTAGATTAGCCAGTGTATTGTTAGATGTTATGCCTGC TTTAAGTAAATAGGGCTCATGACCTTTTTGGAGACAAATACAGGGTTTAGAGGGGTTCACAAGATTAGTTTACATAGCTAGAATGAAAATTGTTCCTATTAGACATTAAACTGTGCCTGCCTTGATATTAGATTAGCCAGTGTATTGTTAGATGTTATGCCTGCGTTATTATTAAAATATTGTAAGACAAAAGCCTGCATTAAGATTTTTAAGTTTTGCTTTTATATTCCATCAGTATATTTATCATTGTCATTAATCATTCAACCATGACATTCTTTCAGTCATTTCATATCATTTGGGGATTCTGGGCTGGGATATTCATTCATCTCAAAATTTGTCACCACTGTATTTTTATGTTGTCTGTCTTGTGTTTTTTTAATGCATAAATGTTTGTGGAATAAAATGTTTTTACCTTGAAAAAAAAGACAAAAGCTTTTATTTGATCCTGCATCACCTATTCAAGAAGAAAATAATTTTATTTCATGATCATGCAATAGTATTGTTGTTAGGAATTTTTAGATTTGTTGCATTTTTAGGGATAAAGTTAATT 3 2 3' arm Biomphalaria_glabrata mirnest 100 100 -14.5 .........((((((.(((.(((((((..(((((.....))))).))).)))).))).))))))........ (-14.5)