mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGTTGTTGATGGACATCAC CAAGTTCATTGACGGCTCTAG AGTTTATATAGAGAGTTGTTGATGGACATCACTGCAAGTTCATTGACGGCTCTAGTCTGTAAA GCTGTTTAACACAGTCTGTGAACTTTAGATCTAGATTTATCTTTCTGTCTGACAGATTACATAAACCCTATCATTTAGGCTTGAAGTTTATATAGAGAGTTGTTGATGGACATCACTGCAAGTTCATTGACGGCTCTAGTCTGTAAATGGCAGAGTCCTCAGTTCCCAGATTGACATCTCAGCACGATCAGGGGATTTACAAATGGGAACATGCTGTTCTACAGGTCGTCAAGAATCGTTAACCGAAGAATGTCAAGGTCACCACAGCTTCTACATCCACCCCGAGGGTTCGTTCAACCAGAGTACCTACAACATTGTATACAGACCACCACAGTTGAATGAACGTCTAGCGCCTGGCGAGGCTAAGCCCAGATTTTGGCTTAACCCGAATAGCTTTGCCAGCGGCCCTGCAGTGGTCAGTATAGCGTGGTGCCAGTTAGGACAGACACATCCAGTGTGTCCCCCACCACGTCCTGTCAATAATAAAAGATGGAA 5 0 5' arm Biomphalaria_glabrata mirnest 100 100 -20.1 ......(((((((((((((((((((((..........)))))))))))))))...)))))).. (-20.1)