mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACTGCATAGCCTGTGACCAG GGTCGTATGCTGTGTCTTTGT AAATCTGTTCTCTGGTCGTATGCTGTGTCTTTGTACGTGTTCTGTACTCCACTGCATAGCCTGTGACCAGTTGCACTGGA GTTTTATAGCAGTGAGGCACTTTACGTTTTCAATCTTTTCTTTTTGTGAGGCTTTAATGGGTCTGTATGCTGTCTAGTGACAGGTTTTGTTTGCCTTCATATTATTATTGGTGGTCTGATGTATGGGTTTAGCTCTTTGCATTATTATGTGTGTTGAAAAAGACACCATATTGTGTGCGAAAAGAATCATTGCTGTTGATAGAACACAGCTTTATTTTCAGTTTCATTCCCAGCAGGTCTTGTAGACAAGGAAAGTTTTTCTGCGCACTTCACAGAGCTGCTAGGTACTCCCTATTTCTTCATGTTTATTCTCTCAACCTTTGTTCAGGCACGTCACTCTCATAAACCTGTAATTTGTCCCCTCACGTCAGGTGTGACTGATGCGTGGCTTTCTTCTTGTGCACAGAGTTTGCGTATGTACTGAGCCCCCTTGATATCGATGGCTGCTTGGTGCGGCGCCTGCATCTGTAGTTTTGCTCATTTTGAGCACTGGGTGAGTTGTGTAACTGTGAGTGTGCGTGTGTGTGGTTTTTTTGTGACCTTATTTGTGGCTTTGGTGATGCCTGATGGGAAACTTGTTGTTACATTTTTTTCGTTTTTACATACAAGGTTTTTGTTTTAGCGTACTCTAACAACGCTGTGTTGAAGCTAGCAAGGTCTTAATGCCTCAAGTTTCATGTTCAGTTTACCTGACAACTGAACAGAAGGAACAAATTCATGTATGCATGCCAGACTTGGAGTGGCAACGTTCTCCGGAAAGGTGCCACGGTTTAAAATCTGTTCTCTGGTCGTATGCTGTGTCTTTGTACGTGTTCTGTACTCCACTGCATAGCCTGTGACCAGTTGCACTGGAAAAAAAAAATACAAAAAGATAAACTGCCTCAATAAACACTGATTGGATA 5 0 3' arm Rhipicephalus_microplus mirnest 100 100 -24.2 .....(((...(((((((((.(((((((....(((((.....)))))......))))))).)))))))))..)))..... (-24.2)