mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATGTGTGTGTACATGTATAC ATATATGTTTGTGCATGCA TTACCACCCTATATATATGTTTGTGCATGCATTTGCATGTGTGTGTACATGTATACACAAATGCA ACTTTGCTATCAAGTATAGTGTTTACTGCTGGGCAAGGGTGTGCTGGACATATTTTTCTAGAGTGTGTTTACCACCCTATATATATGTTTGTGCATGCATTTGCATGTGTGTGTACATGTATACACAAATGCAAAACGTAAACGTTTTGAGGGGTTGAGGGTTGCCACTGCCTCTGGTAATCCTATCTTGTATGTGCACATGTCTTTGCAAAATGGCAGTTGTGTTGCTTGCCGGCACTCAGTATTGTACACTGTATGCACTTACTAATGCTGAAACAACCTCAGAAATTGCTCATCATTATGATTAGGAACATAGTACACCAGCTTAACTCTTCCATCAAGCCCACATTCAGTATAGTGTGAGAGAGAATCTCATTGCTTAACCCCTAAACTGTTTTCAACGAGCACAGTGCAGTGTATAACAGTTGGAGCACGGCCCTTGTCGAGCTGCCCTGTAACAGTTTTGGACAAGCGTAGCTCATTTGGTTGACACTAAGTCCCCCTGCGAGTGTTTTCACCAAGGCACACCCGTTTTCGAACCTGTTTATGTGCTGTTTGGCAGATGACAGAACTGACGTGGTAATCTTTTTTTATTCCTGCACAGTTTCACGTTTTATTTTTCAAAACTTGTGTTTCTAAAGTGTCATTCAACAGAAGTGACAAATGTGTTGTAGAAAATGTTTTTGTTGTCGTCAGAATGTTGAAAATTGTGATAGTGGTGAAACCCTTGTTAGTGCTCAAAATTTCTAAACGTTGGTCTTTGGTTTTTAATTGTTCATTGCCAGTGGATGACTGGCTGTTCCCCTGAGCAACAATGAACTTCATTACTCTAATTGAACATAGGTAGTATGTACTGAAACTTTCTTTTCAGTA 2 2 3' arm Rhipicephalus_microplus mirnest 100 hsa-mir-3149 0.0007 -17.4 ...........(((((((((.(((((((((....)))))))))...))))))))).......... (-17.4)