mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGCTGAGGCAGGAGGATC TCCGCTAGCCTTAGCCTCCTG CCCGACCTCAGGTGGTCCGCTAGCCTTAGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCACCATGGCTGTCCAGCAATTTGTATTTTTAATAAATTCTCCAGTGGGTAGGCCTGGTGGGTCATGTCTGTGGTTCACAGTGCCTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCTGG GCCATTACGGCCGGGGGTCCCCAGTAATCTGTCATTTATTTTATTCGATCAGATTTTATCTTTGAGATGGAGTGTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCGGTGATGCGATCTCGGCTCACCGCGGGCTCCACCTCCCGGGTTCAGGCGATTCTCTTGTCTCAGGCTCCCGAGTGGCTGGAATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTGCATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTGGTCGGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGGTCCGCTAGCCTTAGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCACCATGGCTGTCCAGCAATTTGTATTTTTAATAAATTCTCCAGTGGGTAGGCCTGGTGGGTCATGTCTGTGGTTCACAGTGCCTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCTGGGA 3 0 3' arm Pongo_abelii mirnest Metazoa_SRP 0.0000000000007 hsa-mir-3929 0.0001 -87.2 .(((..((((((((((((.((.(((((((((((.(((.(((((((((((((((((((((.((((((.((((..((.(((((((((.......))))))).....)).))..)))))))))).))))))))))))))).)))))).))).))))))))))).)).))))))))))))..))) (-87.2)