mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGCAACACAGCAAGACTCTG GAGTCTTGCGGTGAGCCGAG GGACATGTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCGGTGAGCCGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGTCTGGGCAACACAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTGAAAGAA GGACATGTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCGGTGAGCCGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGTCTGGGCAACACAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTGAAAGAAAGGTTAAGAAAAACAGGAATGGGAAACTGAGAAACAGAAGGGATAGAAAAAAAATGAATGGCAAACATAAGCCCTA 3 1 3' arm Pongo_abelii mirnest Metazoa_SRP 1e-16 hsa-mir-1273 0.0000000004 -58 ....(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((.(((.((((.((......))......)))).)))..))).))))))))))))))))))))))...)))))))))))))))))........ (-58)