mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGCAACACAGCAAGACTCTG GAGTCTTGCGGTGAGCCGAG GGACATGTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCGGTGAGCCGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGTCTGGGCAACACAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTGAAAGAA GGACATGTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCGGTGAGCCGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGTCTGGGCAACACAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTGAAAGAAAGGTTAAGAAAAACAGGAATGGGAAACTGAGAAACAGAAGGGATAGAAAAAAAATGAATGGCAAACATAAGCCCTA 3 1 3' arm Pongo_abelii mirnest Metazoa_SRP 1.0E-16 hsa-mir-1273 4.0E-10 -58 ....(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((.(((.(((.((((.((......))......)))).)))..))).))))))))))))))))))))))...)))))))))))))))))........ (-58)