mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCAATAAATGCTTGTTGAAT TCCAAGCCTTTGTTTTCCC GGGGCTGACATACAGTAGGTGCTCAATAAATGCTTGTTGAATTTAACTGAACCATGGAACAACGTTAGCCATGGAACAACGTGAATATTCCAAGCCTTTGTTTTCCCATCTGTAAATCACGAATA CGGCCGGGGGGGGACCATTTCTCATTCTCTTTACTTCCCCAGGACCTAGGACAGGGGCTGACATACAGTAGGTGCTCAATAAATGCTTGTTGAATTTAACTGAACCATGGAACAACGTTAGCCATGGAACAACGTGAATATTCCAAGCCTTTGTTTTCCCATCTGTAAATCACGAATAATAATAGCTGCCCTATTTTACTCTGCAGGGGTTTTGTGATGCTTCCTTAGGAAACTGGCTGTGAAGATGCTTTGTAAATTACAAAGACTGTGCACGTGTAACAGGTCATAGAATTGATGGTGATTCTTTACAACAGGTTTTCTGGCCGAACACAAGTGCTCTTGGCCCTCTGAGCCTCAGTTTCTAAATCTGTGGCATAGGCCGAGCTCTGCCTGCTGTACAGGTTATTGAGGATCAACTGGGATGGCATATATTACACAATTGTGTGTCCCCCAGATGGAAGGACTGGCTGTTGCCCATTAACAAATAATTGGGAGGTAACCTGATTCAGCTTGGACAGAAAAAGCTACCCCTGAGCAGAGGCATTTTGCTCCTTTCCTTTTGAAATGGAGAAGAACAAAG 4 2 5' arm Pongo_abelii mirnest 100 eca-mir-95 0.0004 -22.8 .....(((..(((((..((.....((((((.(((((..((((...((((..((((((...........))))))..))..))....))))))))).))))))..))...)))))..)))...... (-22.8)