mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGGTGCAAAAGTAATTGCT CAATTACTTTCACACCAATGT TATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGTAATGGCCACCCGCGTCCTAATGTAGGCCATGCTGCAATTACTTTCACACCAATGTAAT TATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCTGTTTTTGCCATTAAAAGTAATGGCCACCCGCGTCCTAATGTAGGCCATGCTGCAATTACTTTCACACCAATGTAATAACAAACAAAAATGCCTGCCCTCCTAGAACGTACAGTCTGGTAGGAGGGGGCAGAAAATAATAAATAGGCAAAGTATATTGTATGTTAGGTGAAAAGTACAATAAAAATAAAATAGGGGCCAGGCACAGTGGCTCACACCTATAATCCCAGTACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGAGGATCGCTTGAGACCGGGAGTCCAAGGCTGTAGTGAGCCGTGATCACACCACTGCATTCCAGCCTGGTCAACACAGTGAGACCCTGTCTCAAATAAATAAATAAATAGGGAGTTTTGGGTGGCAGGACTGCAGTTTTAAATATGATAGTCAAGATAGATCTCACTGCAATGTGGTCTGAGCATGGGAACAGTTCATGATGGGCCTTCTAGTAACATTCTCAAGCCAAAGACTCCACTCTGGATAGGCATTTCAGAATTTTAGAAAGATGATGGGGAAGATGGTAGATGATCTACGGAAGCTCTTAGCACCCCACAAAGATTCCTCACAGCCTGCCTGTAAGCACCATCCATTGTGCCTTGCCTCATGGAAACACGAAGGGACTGCATGACTTTGATCTTTCCATTTCATAAAGACATACTATAAAGTTCCTTCCTGCATGCCCTCGTGTGGGAGAGCATGGGCCCCAGCCTTGNTCCTTGTGGTCTCTTTANGTCAAGATGCCAGATCCCTCACCATGGAGCCAGCCGCACCAAGCAGGCCCTCCCCCCCAGGAACACTTCCCATTCN 3 0 5' arm Pongo_abelii mirnest mir-548 1e-16 hsa-mir-548i-1 6e-18 -32.3 .((((.(((((((..(((((((((((.((....(((((((....))))))).))..((((((((...))))..)))).)))))))))))..))))))).)))) (-32.3)