mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGATTAAAGGCATGAGCCC GTTCATGCCTGTATTCCCAGC AACAGTGTAAAGGCTGGGCGCTGGTTCATGCCTGTATTCCCAGCTCTTTGGGAGGCCAAGGTGCTGGGATTAAAGGCATGAGCCCCCACTCCTTGCCTCTTACAT CGTTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACTCAGGAGGCGGAACTTGCAGTGAGCCGAGATGGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCCACAGGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAACAGTGTAAAGGCTGGGCGCTGGTTCATGCCTGTATTCCCAGCTCTTTGGGAGGCCAAGGTGCTGGGATTAAAGGCATGAGCCCCCACTCCTTGCCTCTTACATCTTAAAGAATAATTCCTCCAGAGGTTAGGAAAAAGGCACACTTCCAAACACATTCACAAAAGCAGCATAACTCTGGTACCAAAACCAGACATGGACAAATAAAAATAAAAGGACAGGCCAGTACCTCCATGAACATACATGCAAACATCATAAATGTTGAGCACATCAAACTGAGGAGGGAAGGGATTAAATACATATGTGTTTTCATTAAT 3 0 3' arm Pongo_abelii mirnest Metazoa_SRP 0.000000006 100 -51.1 ....((((((((((.(((....(((((((((((.((.(((((((.((((((....)))))).))))))).)).))))))))))).....)))..)))).)))))) (-51.1)