mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGGTGCAAAAGTAATTGCG CAATTATTTTTGCATCAACCT TGAAGCCTGAGCAATTATCAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTTTGCAATTAAACAGTAGTGGNNAAAATCTCAATTATTTTTGCATCAACCTACTTATAATGAATGGTAG TCGGCCATTACGGCCGGGGGGGGGGACAGATGCTGAGAGGACAGGTCCCTGAAGCCTGAGCAATTATCAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTTTGCAATTAAACAGTAGTGGNNAAAATCTCAATTATTTTTGCATCAACCTACTTATAATGAATGGTAGTAAGGATTTGTTTAGCAGCACCTAGAGTGCCTAAGCCAGGGGTCCTGGCTGTGCCCACATTAGCAAGGCAGGAAGATGTGGTGAAGTGACCATCCCTGACCAAGGACCTGATAATGGCCTGGCCCGTGCACTCCTTCAGCGTTCTCAGAAATGTGGCCAACTTCTAAATTTCCCTTGAGGTCAGTGGTGATCTTATAACCAATGCCAACAGCTTTCAGAGCCCACCANGCTCTAAGTAGCTGCCCTGAACTGCCCAGGTTGAAACTCTTCTGCCTCTTCTACCCACAGAAGTAGTGACAGGAAGGGGGAATGAGGATAGCAGCCCTGGGTTTGGCATCTTGTCACCTTGAGGAGTTAATTT 1 0 5' arm Pongo_abelii mirnest mir-548 0.000000000002 hsa-mir-548h-4 0.0000000004 -32.6 ....(((......(((((.(((((((((((((((((((((.((((((...((((.....))))....)))))).)))))))))))))))))))))....)))))....))).. (-32.6)