mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCGGTTTTGCA NAAAATCTCAATTATTTTTGC AGATGCTGAGAGGACAGGTCCCTGAAGCCTGAGCAATTATCAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTTTGCAATTAAACAGTAGTGGNNAAAATCTCAATTATTTTTGCATCAACCTACTTATAATGAATGGTAGTAAGGATTTGTTTAGCAGCACC TCGGCCATTACGGCCGGGGGGGGGGACAGATGCTGAGAGGACAGGTCCCTGAAGCCTGAGCAATTATCAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTTTGCAATTAAACAGTAGTGGNNAAAATCTCAATTATTTTTGCATCAACCTACTTATAATGAATGGTAGTAAGGATTTGTTTAGCAGCACCTAGAGTGCCTAAGCCAGGGGTCCTGGCTGTGCCCACATTAGCAAGGCAGGAAGATGTGGTGAAGTGACCATCCCTGACCAAGGACCTGATAATGGCCTGGCCCGTGCACTCCTTCAGCGTTCTCAGAAATGTGGCCAACTTCTAAATTTCCCTTGAGGTCAGTGGTGATCTTATAACCAATGCCAACAGCTTTCAGAGCCCACCANGCTCTAAGTAGCTGCCCTGAACTGCCCAGGTTGAAACTCTTCTGCCTCTTCTACCCACAGAAGTAGTGACAGGAAGGGGGAATGAGGATAGCAGCCCTGGGTTTGGCATCTTGTCACCTTGAGGAGTTAATTT 4 0 5' arm Pongo_abelii mirnest mir-548 0.000000000002 hsa-mir-548h-4 0.0000000005 -50.1 ...(((((...((((((((((.((..(((......(((((.(((((((((((((((((((((.((((((...((((.....))))....)))))).)))))))))))))))))))))....)))))....)))..)).))))))))))..))))).. (-50.1)