mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAATTTCCACTTCTTTTGTC TGGAAGGAGTGGGGATTAAAA CGTAAAGTGGATTGGAAGGAGTGGGGATTAAAAAGTAAACCACAATTTCCACTTCTTTTGTCTTGCTCTAT ATAATACACACAATTTAATTAATCAACCAATAACATCATCTTTACCATGTAAAGAATATTACATGTATGATGACCCTGTGAATATTATGGGTGAAACATCTATTGGTGGCTTTATTTTCGTAAAGTGGATTGGAAGGAGTGGGGATTAAAAAGTAAACCACAATTTCCACTTCTTTTGTCTTGCTCTATCGTCGAATTTGGTTTTGGAACCTCCTGGCCCCAGTTCAAAGGGTAAATGGAAACAGGTAAATACTTTGTTTTGTCAAATAGCTATCATCAAATTTCAACTAAACTAACAATTTTTTGTGACATATCACCTGCTTCAATTTGACATTGTCATTGTGCAGAAAACAAAAGAAACCAAGCCTTTTAAAAACAAATGCTGCAACTATTGTGGATGGAACAATAGTAGGCTAATGCTTGGAAACATGATTGAAAACTGCTAAAAATTGTTCTGTTCCTTGAGCTCCAGATAGAGATATTGTTTCCCTTTTATCACCACTATTGGTTATTACAAAGTATGGAACACCGGATATTCCCATTTCAGACTTTGCATGCAAATCTTCAGACCAAATCAAATCTACGTCATCTGTTGAATTGAGATACTCTTCAGCTCCTTGTAGGCTAATTTCCTTGGCAGCCTGAATAAGAGTGCCAACATCACTTATATTCATCCCATCTTCATAAATCATTCGAAACAGACATCTTTGCCTTTCCTTGA 4 0 3' arm Acropora_palmata mirnest 100 100 -20.1 .(((.(((((..(((((((((((((((((..............)))))))))))))))))..))))).))) (-20.1)