mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTTGTGTGTATGTTTTTTTT AAAAATGTTGCCATTGATCT AAAGTGCCCCAGAGACAGCCTATTTGTGTGTATGTTTTTTTTGGTTAATTTGTAGAAAAAAAATGTTGCCATTGATCTTGTCCGCGGACTATCGTA CGCCCAAGAAAGTGCCCCAGAGACAGCCTATTTGTGTGTATGTTTTTTTTGGTTAATTTGTAGAAAAAAAATGTTGCCATTGATCTTGTCCGCGGACTATCGTACCGTAAAAGTGAATGTGATTGTGTTGATTTGCATCGTGATCGCGGTCAACGCACCACTTTCTTCTCAGGCATCACCAACAACACCAACTGCAGACGTGCAGAGTGATGTTTTAGTGATAAGTCCACAGCCATTTGAGAATAGCACCGAACCGGAATTATTGGATAATCCACGTGATGAAGATGAAAGTGTTTCCACTGATCATCCAGTCAAGTACACTGGTGCCCAACTTTGGCGCATTTCATACGATGATCAAGTACGGAAGAATGCCGTAGCAGATCTTCAGCATAAATTCAATGTTGCAATGTGGAATCTCAATGGTACTTCTGTTGATATGTTCCTCAAGAAGCCCGTGATTGCCGATGCTAGGAAATTGTTGGAAAATGCCAAAGTGCCCTTTGATGTGGTAATCGATGATCTTCAGCATGCAATTGATACTGAAAAATCCACCG 4 1 5' arm Phlebotomus_papatasi mirnest 100 100 -15.3 .............(((((...(((.(((.(((...(((((((..(((.....))).)))))))...)))))).))).))))).((((....)))). (-15.3)