mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGGCTGCGCACGGAGAAGGC TGGACCTGCTGCGCCGGCTGGAA CCTACCCGGTGACCCTGCCCGAGCTGGAAGACCGGCTGCGCACGGAGAAGGCACTGAATCCCGACTTTCCGGTGATCGTGCGCGGCGACTCCGCCGTGCAGTACCAGAAGGTGGTGGAAGTGCTGGACCTGCTGCGCCGGCTGGAACTGGCCCAGGTCGGGCTGGTCACCGGCA GATGGTCGTGCTGGTCATGTTCATCCTGACCGCCACGGCGCAGATCGCCGGCATCAAGGTCAACCTGCCCAAGGCCAGTTCGTCCATCGCCCTGTCGCAGCCCAAGACCAAGGCCATTTCCGTCAACGACGCCGGCCAGGTGTTCCTGGACGCCTACCCGGTGACCCTGCCCGAGCTGGAAGACCGGCTGCGCACGGAGAAGGCACTGAATCCCGACTTTCCGGTGATCGTGCGCGGCGACTCCGCCGTGCAGTACCAGAAGGTGGTGGAAGTGCTGGACCTGCTGCGCCGGCTGGAACTGGCCCAGGTCGGGCTGGTCACCGGCAAGCCGAAATAAGGGGCCGAGGCGACTGTCATGCCGCACCACGCATCCGATTCCCCGCGCACCCCCCATCCCGCGCGCCGCTGGCTCAAGCTGGCGGCGGTCGCGGTGGTGTTGATC 4 2 5' arm Anemonia_viridis mirnest 100 100 -88.8 .....(((((((((..((((((.((((.((.((((((((((((((....((((((...((((.((((((.((((....(((((((((....))))))))).)))).)))))))).)).))))))....))).)))).)))))))..))...)))).)))))).))))))))).. (-88.8)