mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGCTGCTGCTGTTGCTGCT CAGCAATGGCATAGTAATGT GATGTATGATGCTGTTGTTGCTGCTGCTCTTGTTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGATGATAATGATGACAGCAATGGCATAGTAATGTCAGTGTTAATGACAGTGAATGCTTGTGG GCAAGAATGCTTTTGATATTTTTGTGCTCTTGACCATCACATGTATCCTTCAATCAGGCTAAGCTACCAATCAGCTAACTGGCGGCAGATTGTGAGGGGTGGGACAGAGATGTATACGGGGGGTGGGGTGGGGACTGTATGCTAATACTGTAGATTATGCTTTGACTATAATTTGGAAGGACCTAAGAACTCTCAAAAAATCTTATTTTGGATAGATATTTGTTTTGTAGAAGCAAAAATTAACATGATTGTTGGTTGTCGGAAGTGATGCAACAGACACTCAATTGAATACTTATAGGATATAGGTTTGCTATCAACCTTGAGAAACTGAACATTCCATGATACTGATGAAAGTTGGTGATGATGATGATTTTGATGAAGGTATCTGCTACTGATAGTTGATCATTGATGATAGTGGTGGTTGGTGATGATGATGATGATGATGATGCTAGAGTCAAAAGAGATGCAAAGTTTGATGATGATGATGATTCATGTAATGTCATCAATGACTGATGCTGGTGGTTTTTAATGGTGATTGATAATGATGCCCATGATGATTCTCAGGATGTATGATGCTGTTGTTGCTGCTGCTCTTGTTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGATGATAATGATGACAGCAATGGCATAGTAATGTCAGTGTTAATGACAGTGAATGCTTGTGGTAATAGCAAGGTTGATGAACATGATATTCACAAGTTGCATTGGTGATGATGACAGTGATGTTGATGTTGTTGATGATGATGATGATGATACATGATGATGATACATGATGATGATGAAAATGATGATGATGGTGGTCATGGTTGCTCATACGGTGATGATAGTGATGAAGATAATACCTTTTATCAATGATGCATATCATAATGATGATAGCAGTGAATTTCACTAAGAATGAAGATGATGGTGATGATCATGATGATGACGGCGATGTATGGTCATATACTTCTAGCAACTAGATACATTGTTTACTCAGGCATGAGTTTTCAATAATTTAATATTCTTATAAAGCAAATAATATAGTATAGAAAGTAAGGGCTTCCAAACATGTAATTCTTTCAAATGATTTAATAATATTTCAATTTC 2 1 5' arm Anemonia_viridis mirnest 100 100 -35.8 ...((((..(((((((((((.(((((....((((((((.(((((((((((................))))))))))))))))))).))))).))))))))))).))))...... (-35.8)