mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGCTGCTGCTGCTGCTGCT TGGNGGCGGCGGCGGCAACAA CGGCTGGTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCGGTCCGCCGGCGGTTGCTATTGCTATTTGCTGNATGCAATACCGCCCGCTGCTGGTGNTGCTGCGTTGCCCGAGCCCGAGCCCGAACCCGANCCGATAGCTGCGGCAGGAGTGGNGGCGGCGGCGGCAACAATGACGACG TGTGTTGATGCTGTTGTTGGTAGCTGTCTAGCTTTTAATGTTTAATGCTTACATAATTTTTCTTTCAGTAATTATTATTAAATTATTTCCGTTTATGCTGTTCTGTTTTCGGTTCGGTTCAAACACACACTTTATTCCCAGTCCGCCACCAATCCATCCGCCAATAGTTGCAATAGCTATAGCTGCTGCTGCTGCTGCGGCTGGTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCGGTCCGCCGGCGGTTGCTATTGCTATTTGCTGNATGCAATACCGCCCGCTGCTGGTGNTGCTGCGTTGCCCGAGCCCGAGCCCGAACCCGANCCGATAGCTGCGGCAGGAGTGGNGGCGGCGGCGGCAACAATGACGACGATGGCGGCGGCGGCAGCTGCTGATCTTGTTGCTGCCGCTGCAGATGCAGTTACTGATGTTGGTGTTACAGCNGCTGCGNCTGCCGCTGCTGGTGCTTCGATTGTTGATGACGATGTGGATGCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTGA 1 0 5' arm Drosophila_auraria mirnest 100 100 -70.4 ((.....(((((((((((((((((((.(((((((.(.((((.(((((((((....((.....)).....)))..)))))).((((.(((...((...((..((.((....)).)).))....))..))).)))).))))).))))))).))))))))))))))))))).))... (-70.4)